Jest twórcą projektu elChopin, który jest pierwszą w historii reinterpretacją 24 preludiów op.28 F.Chopina za pomocą instrumentów elektronicznych i elektroakustycznych.
Odnajduje się też znakomicie w muzyce filmowej, będąc autorem muzyki do wielokrotnie nagradzanych filmów VR „Kino”, „Nie kochać w taką noc”, „Dża Dża”, serialu telewizyjnego „Szadź” (TVN) oraz wielu filmów dokumentalnych oraz offowych.
W 2022 roku jego muzyka do spektaklu Słońce Kopernika w reżyserii Emiliana Kamińskiego zachwyciła zarówno publiczność jak i krytykę: "...Muzyka [Bartłomiej Zajkowski] kapitalnie uzupełnia całość spektaklu. Nie są to żadne „Aaaa, kotki dwa!”, już jeżeli z czymś ją porównywać, to do muzyki Andrzeja Korzyńskiego z „Akademii Pana Kleksa”. A wiadomo, jakie tam były hity!" - Krzysztof Stopczyk, e-teatr.pl
Jest też twórcą, poszerzających doświadczenie percepcji, wielokanałowych przestrzeni dźwiękowych do wystaw oraz instalacji w galeriach sztuki (m.in CSW, BWA Nowy Sącz), a także muzyki do happeningów, działań performance oraz pokazów mody.
Na fortepianie gra od 12 roku życia a studia pianistyczne pod kierunkiem m.in prof. Jana Ekiera ukończył z wyróżnieniem. Jest laureatem Ogólnopolskiego Konkursu im. Fryderyka Chopina w Warszawie TIFC. Występował na festiwalach: w Dusznikach Zdroju, w Żelazowej Woli, Festiwalu Pianistyki Polskiej w Słupsku, La Folle Journée, Warszawska Jesień, Musica Eletronica Nova oraz Kwartesencja, prawykonując utwory takich kompozytorów jak Hanna Kulenty, Dariusz Przybylski, Andre Werner, Aleksandra Gryka oraz Adrian Foltyn.
Występował i współpracował z takimi zespołami i solistami jak Kwartet Smyczkowy "Camerata", AUKSO, Polska Orkiestra Radiowa, Orkiestra Uniwersytetu Muzycznego im. Fryderyka Chopina w Warszawie, z Jakubem Jakowiczem, z „Royal String Quartet” , „Kwadrofonik” oraz „Kwartludium”. W 2020 roku w ramach stypendium Ministra Kultury i Dziedzictwa Narodowego prowadził cykl koncertów i improwizacji „Zajkowski na dobranoc”.
Jako pianista specjalizuje się w repertuarze XIX wieku oraz w improwizacji.
Od 2023 roku Bartłomiej Zajkowski pełni funkcję kuratora muzycznego Festiwalu „Kresy–Bezkresy” w Tykocinie.
Współpracował m.in. z:
Akson Studio, Arteria, Aukso, Banki Spółdzielcze, BWA w Nowym Sączu, CSW w Warszawie, Dwójka Polskie Radio, ernst & young, Estrada i Studio, Festiwal Kresy - Bezkresy, Festiwal Pianistyki Polskiej w Słupsku, Filharmonia Rzeszowska, Filharmonia Wrocławska, Fundacja Dziedzictwo Europy, Fundacja EFC, Fundacja Forani, Fundacja Muzyka Jest Dla Wszystkich, Galeria Sztuki SCENA, Kayax, Mała Galeria, Międzynarodowy Festiwal Chopinowski w Dusznikach Zdroju, Musica Eletronica Nova, Muzeum Okręgowe w Nowym Sączu, Orlen, Polska Orkiestra Radiowa, Radio RDC, Sony Music Publishing, Steinway, Stowarzyszenie Dramma Per Musica, Tak Bardzo, Teatr Kamienica, Teatr Soho, TIFC, TVP, TVP Kultura, TV Republika, Warszawska Jesień, Żelazowa Wola, Związek Kompozytorów Polskich